この国際規格は、PCR ベースの技術を使用して土壌細菌群集の全体構造と存在量を分析するために、土壌サンプルから DNA を直接抽出する方法を規定しています。
この方法は主に農業および森林の土壌に特化しています。
この方法は、有機物が豊富な土壌 (泥炭土壌など)、または有機汚染物質や重金属でひどく汚染された土壌には適さない可能性があります。
土壌サンプルから DNA を直接抽出することにより、土壌微生物相の生物多様性を推定するための重要なパラメーターである微生物群集の豊かさと構造について独自の洞察が得られます。
土壌 DNA の PCR (ポリメラーゼ連鎖反応) 増幅に基づく分子的アプローチは有望な領域を構成しており、近い将来、土壌環境の微生物叢を監視する日常的なツールの開発に貢献する可能性があります。
この方法のユーザーは、DNA 抽出手順に供された土壌は完全にふるいにかけられますが (2 mm メッシュ、手順は 5.1 で説明)、植物残留物が依然として土壌サンプル中に残る可能性があり、その結果、微量の植物 DNA が残留する可能性があることを認識する必要があります。
土壌 DNA 抽出物が汚染されます。
ISO 11063:2012 規範的参照
ISO 10381-6 土壌の品質、サンプリング、パート 6: 実験室での微生物学的プロセス、生物統計および多様性評価のための、好気条件下での土壌の収集、取り扱い、保管に関するガイドライン。